9月1日，召开全球基金CSW社区组织项目总结会。

9月1-10日，完成三季度结核病进展及药品库存信息季报表。

9月2日，召开检测工作及收费程序座谈会。

9月3日，对舒城阙店卫生院开展卫生帮扶活动。

9月3日，五省疟防检查团赴舒城县开展疟疾防控工作检查。

9月4-6 日，赴捷成木业开展职业卫生现状评价现场检测。

9月5日，申报国家2014年建设规划项目。

9月5日，对金寨县开展艾滋病防治数据质量复查。

9月9-10日，合肥市赴裕安、霍山开展疟疾联防检查。

9月10日，省皮防所王强副所长一行来我市开展麻风病防控工作调研督导。

 9月10-18日，对安徽国防科技职业学院和皖西卫生职业学院新生开展健康体检，共体检3857人。

9月 10-25 日，派员赴月亮岛开展2013年第十五届亚洲赛艇锦标赛和全国青年U-1赛艇锦标赛病媒生物监测和疾病预防控制工作。

9月11日，安医大8名实习生来中心实习。

9月12-17日，开展9月份病媒生物监测工作。

9月16-17日，派员参加省性艾协会会议。

9月16-22日，完成9月份食品安全风险监测工作，共检测烧烤类等食品微生物样本和水果、茶叶等理化样本30份。

9月17日，派员参加安徽省学校结核病防治视频会。

9月18日，赴海螺水泥厂开展职业卫生日常检测。

9月20-30日，编制2014年项目预算报表。

9月22-24日，赴舒城县、金安区、裕安区疾控开展三季度结核病防治常规督导。

9月22-25日，派员赴安庆参加全省重点传染病培训班。

9月22日-10月25日，马功燕参加市委党校举办的2013年秋季乡科级干部进修班。

9月23-24 日，对长江精工钢构公司、英瑞针织开展职业卫生现场检测。

9月23-26日，派员参加省皮防所举办的全省麻风病防治知识培训班。

9月24-25日，派员参加安徽省结核病耐药监测培训班。

9月24-26日，派员赴合肥参加省胸科医院组织召开的结核病临床路径培训班。

9月24-27日，拍摄中心成立10周年宣传片。

9月25日，市卫生局督查我中心2012年-2013年政府采购情况。

9月26日，对捷成木业52名工人开展职业健康监护工作。

9月27日，赴市立医院开展洁净手术室净化效果检测。

9月27日，安医大卫管学院王德斌副院长一行来中心商谈科研项目《前糖尿病综合防控项目》合作事项。

9月29日，举办全市发热伴血小板减少综合征防治技术培训班，各县区卫生局、市疾控中心及城区部分医疗卫生单位相关领导及业务人员共50余人参加了会议。

9月30日，市局督导我中心政府采购工作。

9月，质管科受理委托检测样品83份，出具报告83份。

9月，完成安捷伦7890B气相色谱、戴安ISC-1100离子色谱安装、调试、培训工作。